现在，全世界所有人都在使用的智能手机App。　　那里潜藏着无人知晓的存在·Applimonster，通称“Appmon”。　　Appmon是具备能够自主思考行动的人工智能的App生命体，　　在人类世界与数码空间的间隙中，为系统及人类发挥着机能。　　但，潜藏在网络之海中的“凶恶的最终BOSS人工智能·利维坦”　　化作疫毒控制了Appmon们，并开始黑入各个系统，　　企图从网络一侧控制人类的世界。　　主人公少年·新海春，　　获得了被伟大的意志引导的“App驱动”，　　并使来自“App芯片”的搜索App·GATCHIMON实体化了。　　隐藏在“App驱动”中的疑云，　　处在Appmon所潜藏的网络世界与现实世界之间的不可思议的“场”，　　以及2只Appmon进化的“App合体”到底是什么？“利维坦”真正的目标究竟是……！？　　爱好读书的少年春，与搜索App的怪兽·GATCHIMON这一对凸凹组合，　　奔驰于现代世界的新感觉搭档物语，　　现在启动！